e-Taxで申告したつもりが無申告になっていたケース｜受信通知（メッセージボックス）の確認を怠ると起きること

「e-Taxで送信ボタンを押したから、申告は終わったと思っていた」「後日、税務署から『申告書が提出されていない』と連絡が来た」——e-Taxで申告したつもりが、実は送信エラーで受け付けられておらず、無申告になっていたというケースがあります。

e-Taxは、税務署に行かずに申告できる便利な仕組みですが、「送信した」と「受け付けられた」は同じではありません。申告が受け付けられたかどうかは、e-Taxのメッセージボックスに届く「受信通知」で確認する必要があります。

この記事では、e-Taxで無申告になってしまう原因と、受信通知の確認方法、万が一無申告になっていた場合の対処法をわかりやすく解説します。

なお、e-Taxの画面や手順、税法の取扱いは変更されることがあります。本記事は執筆時点の情報をもとにしていますので、実際に手続きをする際は、国税庁やe-Taxの公式サイトの最新情報を確認するようにしてください。

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「送信した」と「受け付けられた」は違う

e-Taxで申告書を送信すると、主に次の2つの通知が表示・送付されます。

通知	タイミング	わかること
即時通知	送信した直後に画面に表示される	データがe-Taxのシステムに到達したこと（到達日時、受付番号など）
受信通知	送信後しばらくしてメッセージボックスに格納される	送信したデータの形式などのチェック結果。問題がなければ受付が完了し、エラーがあればエラーの内容が表示される

即時通知は「データが届いた」ことを示すだけで、申告書として正しく受け付けられたかどうかは、受信通知を見なければわかりません。受信通知にエラーが表示されている場合、その申告は受け付けられていないため、修正して送信し直さない限り、申告したことになりません。

つまり、「送信ボタンを押した」「即時通知の画面が出た」だけで安心してしまうと、エラーのまま申告期限を過ぎ、結果的に無申告になってしまうおそれがあるのです。

無申告になってしまう主な原因

原因	よくある状況
受信通知でエラーが出ていた	電子署名の不備、添付すべきデータの不足、入力内容の形式エラーなど。送信後に受信通知を開いていなかった
送信が完了していなかった	送信の途中で画面を閉じた、通信が切れた、最後の「送信」ボタンを押す前に作業を終えた
「作成」と「提出」を混同していた	確定申告書等作成コーナーや会計ソフトで申告書を作成・保存しただけで、送信していなかった
会計ソフトのステータスが「未送信」のまま	会計ソフトから電子申告する際、送信の操作が途中で止まっていた
電子証明書の有効期限切れ	マイナンバーカードの電子証明書などの期限が切れていて、署名ができていなかった
税理士に任せきりで確認していなかった	税理士が代理送信したと思っていたが、実際には送信されていなかった、エラーが出ていた
期限ぎりぎりの送信	期限当日の夜にエラーが出て、修正が間に合わなかった

法人の場合は、法人税・消費税（e-Tax）とは別に、法人住民税・法人事業税をeLTAX（地方税のポータルシステム）で申告します。e-TaxとeLTAXのそれぞれで、受け付けられたかどうかを確認する必要があります。

受信通知の確認方法

個人の確定申告（確定申告書等作成コーナーから送信した場合）

送信が終わったら、表示される送信結果の画面で、受付番号や到達日時を確認する
e-Taxのメッセージボックスにログインする（マイナンバーカードやマイナポータル連携、ID・パスワードなど）
送信した申告の受信通知を開き、エラーの表示がないかを確認する
受信通知の内容をPDFなどで保存し、申告書の控えと一緒に保管する

会計ソフトから電子申告した場合

会計ソフトの電子申告の画面で、ステータスが「送信済み」「受付完了」などになっているか確認する
多くの会計ソフトでは、ソフト上で受信通知（受付結果）を確認できる。確認できない場合は、e-Taxのメッセージボックスで直接確認する
法人の場合は、eLTAX側の受付結果も確認する

税理士に申告を依頼している場合

税理士が代理で送信している場合も、受信通知（受付結果）の控えを送ってもらうようにしましょう。申告書の控えだけでなく、受け付けられた証拠をもらっておくことで、確認漏れを防げます。

確認するときのチェックポイント

受付番号と受付日時が記載されているか（受付日時が申告期限内か）
エラーやお知らせのメッセージが表示されていないか
提出先の税務署、税目、年分（事業年度）が正しいか
添付書類（青色申告決算書、財務諸表など）もあわせて送信されているか

申告と「納付」は別に確認する

申告が受け付けられても、税金の納付が終わったわけではありません。e-Taxで申告した場合の主な納付方法と、確認するポイントは次のとおりです。

納付方法	確認するポイント
ダイレクト納付（口座からの引落し）	申告とは別に納付の手続き（指定）が必要。引落日と口座残高を確認する
振替納税（個人の所得税・消費税）	事前の届出が必要。振替日に口座残高があるか確認する
インターネットバンキング・クレジットカード・スマホアプリ納付など	手続きが完了したことを、受付の画面や明細で確認する

「申告はしたけれど、納付を忘れていた」場合は、無申告ではありませんが、延滞税がかかります。申告の受付と納付の完了は、別々にチェックしましょう。

無申告になっていたらどうなる？

受信通知のエラーに気づかず、申告期限を過ぎてしまった場合は、期限後申告（無申告の状態から申告すること）になります。主に次のような不利益があります。

不利益	内容
無申告加算税	原則として納めるべき税額の15％（金額に応じて20％・30％）。税務署の調査の通知を受ける前に自主的に申告すれば5％に軽減
延滞税	本来の納期限から納付した日までの日数に応じてかかる
青色申告特別控除の減額（個人）	65万円（または55万円）の青色申告特別控除は期限内の申告が要件。期限後申告になると、控除額が10万円になる
青色申告の取消し（法人・個人）	2期（2年）続けて期限後申告になると、青色申告の承認が取り消されるおそれがある

特に個人事業主にとって、65万円の青色申告特別控除を失うのは大きな痛手です。所得税と住民税をあわせると、税負担が十数万円以上増えることもあります。

気づいたら、すぐに送信し直す

無申告に気づいたら、エラーの内容を確認して、すぐに正しく送信し直しましょう。

法定申告期限から1か月以内に自主的に申告し、期限内に申告する意思があったと認められる一定の場合（納付も期限内に済んでいる、過去5年以内に無申告加算税などを課されていない、など）は、無申告加算税がかからないことがある
それ以外でも、税務署の調査の通知を受ける前に自主的に申告すれば、無申告加算税は軽減される
延滞税は日数に応じて増えるため、納付も早く済ませる

なお、e-Taxのシステム障害など、納税者の責任ではない理由で期限内に送信できなかった場合は、申請により期限の延長が認められることがあります。期限の直前に障害が起きた場合は、国税庁の案内を確認しましょう。

法人の申告期限や、期限に間に合わないときの選択肢については「法人税の申告期限と延長の特例」で解説しています。